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药物化学实验室拥有一支以博士、硕士为主的研发团队，主要从事具有良好药理活性的皂苷类化合物的研究和开发。包括具有生物活性天然皂苷化合物的全合成，皂苷体内代谢产物的鉴定及合成，糖类化合物的全合成等。先后承担了包括国家“863计划”、国家重大专项、国家自然基金会项目和上海市科委重点项目等多个重大科研项目，并获得多项发明专利。
皂苷是一类重要的天然产物，在我国作为传统中药最大来源的7294种药用植物中，半数以上都含有皂苷。天然皂苷在自然界中含量低，分离过程复杂，得到的某些皂苷有时活性不强或毒性大，难以直接开发成新药。皂苷元相对于皂苷而言较易分离得到，易于工业化生产。本实验室系统地研究皂苷的化学结构及生物活性，以具药理活性的天然皂苷为药物先导体，研究其结构与活性的关系并进行结构修饰和优化，从而开发疗效好而毒副作用小的具有自主知识产权的原创新药。
本实验室经过多年研究积累，建立了国内外首创的皂苷大量合成法，可独立进行从毫克级到千克级的皂苷定向合成，并突破性地实现了高纯度皂苷样品的公斤级生产。
本实验室具有200L，50L中试反应釜，配备现代化的分析检测手段（NMR，LC-MS，HPLC等），可为客户通过半合成的方法提供各种天然或人工设计的皂甙类化合物样品和糖基化合物中间体（特色产品见化学合成目录）。并开展从毫克到公斤级的化合物定制和工艺开发服务。
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天然产物目录
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医药中间体目录
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20(S)-人参皂 苷Rh2
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原人参二醇
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延龄草苷
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原人参三醇
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薯蓣皂苷
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五-O-苯甲酰基-D-吡喃葡萄糖
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重楼皂苷
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2,3,4,6-四-O-苯甲酰基-D-吡喃葡萄糖
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纤维二糖苷
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四-O-苯甲酰基-L-吡喃鼠李糖
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红景天苷
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2,3,4-三-O-苯甲酰基-L-吡喃鼠李糖
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白桦酯醇
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四-O-乙酰基-L-吡喃鼠李糖
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白桦酯酸
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羽扇豆醇
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